El monje agustino san Nicolás murió en Tolentino en 1305 y fue enterrado en la cripta de este santuario, cuya construcción iniciada aquel año se alargó hasta el s. XVIII, lo que explica su aspecto compuesto. Una portada de estilo gótico tardío, obra de Nanni Bartolo (discípulo de Donatello), un fastuoso decorado de dorados, mármoles y estucos y los frescos de la gran capilla de San Nicolás (escuela de Rimíni, s. XIV), son los elementos más notables de esta basílica.