Las colecciones prehistóricas y galorromanas muestran los dos grandes periodos de poblamiento del yacimiento de Saint-Marcel: por una parte, un impresionante material del Magdaleniense (14000 a.C.) y por otra, piezas sobre la Galia de los artesanos y de los comerciantes, los ritos funerarios y las prácticas religiosas. En la cripta arqueológica, pueden verse los imponentes vestigios del foso norte, de una zona de talleres y de bodegas, donde permanece en el mismo lugar en el que se descubrió (en 1986) un altar domestico.