Entre sus piezas más destacadas hay que mencionar el coro, obra maestra románica donde se representa la Nueva Jerusalén, una custodia dorada de Antonio de Arfe (1539-1566) y los magníficos tapices confeccionados según cartones de Goya, Bayeu, Rubens y Teniers. La entrada da acceso también al claustro (principios del s. XVI), de estructura gótica y con ornamentaciones platerescas, al palacio de Gelmírez, que contiene una cocina medieval y el salón sinodal, y a la cripta del Pórtico de la Gloria, construida en el s. XI.