La historia colonial española en Alta California comienza en lo alto de esta imponente colina desde la que se divisan amplias vistas de la ciudad de San Diego. Este magnífico parque paisajístico alberga un elegante museo de historia y los restos arqueológicos de la primera colonización europea de la costa oeste. En 1769, las dos columnas de la expedición sagrada encabezada por Gaspar de Portolá y fray Junípero Serra llegadas por mar y tierra designaron esta colina como el emplazamiento para la misión y el presidio. Aunque la misión fue trasladada en 1774, el Presidio Real, como se empezó a llamarse por aquel entonces, siguió funcionando como destacamento militar durante la época española. Después de la independencia mejicana en 1821, sus ocupantes decidieron trasladarse a Old Town y la fortaleza quedó abandonada. A principios del s. XX, George White Marston compró buena parte de Presidio Hill y mandó construir el Junípero Serra Museum.