Como en todas las iglesias de las congregaciones femeninas, la entrada de la iglesia de Santa Clara se hace por uno de los laterales. Construida en 1606, destaca por su increíble decoración interior. El coro desde donde las religiosas asistían a los oficios está separado de la nave por una magnífica verja de hierro forjado. Los retablos laterales, primorosamente tallados y dorados con pan de oro, dejan rienda suelta a la exuberancia del barroco churrigueresco. Echamos en falta el retablo del altar mayor, que fue sacrificado en aras de la moda neoclásica.