Este museo así bautizado en honor al célebre médico Herman Boerhaave hace un recorrido por cinco siglos de ciencias naturales y medicina. Entre los numerosos objetos de interés expuestos cabe destacar la colección Christiaan Huygens (1629-1695, físico y astrónomo de renombre internacional), algunos instrumentos astronómicos y quirúrgicos y los microscopios de Van Leeuwenhoek.