Esta iglesia de principios del s. XVI está rematada con almenas y agujas cónicas (en algunos casos torsas). La portada, de estilo manuelino, está presidida por un pelícano -emblema del rey Juan II- y la esfera armilar del rey Manuel. En el presbiterio, al fondo de una amplia nave con bóvedas ojivales, se encuentran las tribunas, una renacentista y la otra barroca. La impactante capilla de los Huesos está totalmente recubierta con huesos y cráneos de 5.000 personas.