El Museo de Borda, acondicionado en la capilla del Carmen, organiza cada año varias grandes exposiciones temporales con piezas de sus propios fondos (paleontología y arqueología, ciencias e historia, bellas artes y artes gráficas, etnología...). Fundado en 1807 y regentado por la famosa Sociedad Arqueológica e Histórica de Borda desde la creación de esta última, el museo debe su nombre a Jacques-François de Borda (1718-1804), pariente del matemático y marino Jean-Charles de Borda y uno de los primeros prehistoriadores.