Santo Domingo de Guzmán está enterrado aquí en un admirable sarcófago de Nicola Pisano (1267) coronado por un grupo escultórico que fue añadido posteriormente por Niccolò dell´Arca y terminado por Miguel Ángel en 1494. Los bajorrelieves de Pisano representan la vida y milagros de santo Domingo. Destacar también el Matrimonio místico de santa Catalina (1501) de Filippino Lippi, en una capilla a la derecha del altar mayor, y la Crucifixión de Giunta Pisano.