Esta imponente basílica consagrada en 1253 encarna la evolución de los franciscanos hacia el boato y la decoración bajo la influencia del hermano Elia, encargado de su construcción. Consta de una basílica inferior, robusta, oscura y decorada con frescos de Simone Martini, y de una basílica superior, alta, esbelta y con una lograda y espectacular estructura gótica decorada con un admirable ciclo de pinturas de Giotto con escenas de la vida de san Francisco.