Abierto en 2003, acoge alrededor de 2.000 piezas antiguas, que van de la época faraónica a los períodos copto e islámico, pasando por la época grecorromana... Sin olvidar, por supuesto, los hallazgos submarinos encontrados en las costas de Alejandría por los equipos franceses de Jean-Yves Empereur y de Frank Goddio. Entre los tesoros del museo destaca la bella colección de tanagras, figurillas de terracota provenientes de necrópolis de Alejandría.