El Takayama Ninja House está situado en una zona de conservación en una de las pocas ciudades históricas que quedan en Japón, donde está la ciudad de Takayama. La calle más famosa de Takayama, Sanmachi-dori, está a solo 8 minutos a pie. El Takayama Ninja House ofrece habitaciones con aire acondicionado y WiFi gratuita en todas las instalaciones. El establecimiento alberga un bar. Hay aparcamiento privado (1.000 yenes por noche). Se ofrece servicio de traslado gratuito bajo petición previa. El Takayama Ninja House se encuentra a 300 metros del Museo de Historia Local y a 400 metros del centro histórico de Takayama.