Este museo consagrado a la antropología, la historia antigua y las culturas indígenas ocupa el California Building, célebre por su campanil de 55 m de altura y su carillón. En el bajo se exponen réplicas de las estelas halladas en la ciudad maya de Quirigua, en Guatemala. En la 1 planta, la exposición "Early Man" incluye un vaciado de Lucy, antepasado bípedo del hombre. "Life and Death on the Nile" (vida y muerte en el Nilo) presenta momias, una colección de estatuillas funerarias y otros objetos del antiguo Egipto. Otra sección expone momias peruanas, mejicanas y egipcias. Las exposición "Life Cycles and Ceremonies" presenta una panorámica de los ritos relacionados con la pubertad, el matrimonio, la unión sexual y el nacimiento, mientras que "Kumeyaay: Native Californians" le hará descubrir la artesanía y el modo de vida de los kumeyaay, tribu descubierta por los misioneros a finales del s. XVIII. El Discovery Center invita a los más pequeños a explorar los misterios del antiguo Egipto.