La visita del museo complementa a la perfección la de la zona arqueológica, sobre todo teniendo en cuenta que los preciosos objetos que se exponen gozan de una majestuosa puesta en escena. Aquí podrá hacerse una idea de cómo era la famosa tumba de Pakal II (Templo de las Inscripciones), reconstituida en una sala especial. Destacan los incensarios de cerámica procedentes del Grupo de la Cruz, las joyas, las cabezas de estuco y, sobre todo, los tableros de glifos (Tablero del Palacio) o con bajorrelieves históricos (tablero policromado del s. XIX), que permiten observar el grado de refinamiento conseguido por calígrafos y artistas.