Situado en dos edificios distintos, el ala oeste del monasterio de los Jerónimos y el pabellón de los Galeotes, el Museo de la Marina es un conservatorio del pasado marítimo portugués. En él pueden verse numerosas maquetas de embarcaciones de diferentes épocas que ilustran los descubrimientos, la marina militar -numerosos mapas antiguos- y la marina pesquera. La embarcación más destacada por su decoración es el bergantín real construido en 1778 con motivo del casamiento del futuro rey Juan VI.