El templo se presenta como una verdadera ciudad religiosa, dedicada por completo al culto de la diosa madre. El patio interior, después del 1º pilono dedicado a Ptolomeo XII, conduce al Mammisi, donde se celebraba el nacimiento de Horus. Tras el 2º pilono, se penetra en el santuario de Isis propiamente dicho: admire el techo de la pronaos que conserva restos de su decoración pintada, la naos, que encierra la tumba de Isis, con sus bonitos relieves que muestran la ofrenda realizada por el rey a Hator dando de mamar al niño-dios.