El Vatican Tolemaide 2 se encuentra en el distrito romano de Vaticano Prati, a 500 metros de los Museos Vaticanos y a 10 minutos a pie del Castel Sant'Angelo. La plaza de San Pedro está a 700 metros.
La Piazza del Popolo está a 1,7 km. El aeropuerto más cercano es el de Roma Ciampino, ubicado a 34 km del Vatican Tolemaide 2.